Die Stiftung gehört zu den führenden Institutionen zur Vermittlung von Zeitgeschichte. Dem Wissenschaftlichen Beirat gehören Historiker, Politikwissenschaftler, Staatsrechtler und Museumsfachleute an. Er berät das Kuratorium und den Präsidenten der Stiftung, insbesondere bei der konzeptionellen Vorbereitung der Wechselausstellungen und bei der inhaltlichen Arbeit an der Dauerausstellung.

Die Stiftung Haus der Geschichte der Bundesrepublik Deutschland ist an drei Standorten vertreten: in Bonn mit dem Haus der Geschichte, in Leipzig mit dem Zeitgeschichtlichen Forum und in Berlin mit der Kulturbrauerei und dem Tränenpalast.

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